Udenfor Lithauns hovedstad Vilnius ligger en bygning uden vinduer og med fuldstændig støjisolerede celler. I 2005-06 blev den brugt af CIA til tortur af fanger. Det er en statslig bygning, men Lithaun har ikke for tiden brug for torturcentre, og den statslige myndighed der administrerer statens bygninger har derfor sat den til salg.

Lithaun har efter en retssag mod landet indvilget i at betale 100.000€ i erstatning til Guantanamo fangen Abu Zubaydah. Beslutningen er faldet 3 år efter den Europæiske Menneskerettighedsdomstol pålagde landet at betale erstatning. Zubaydah blev i 2005-06 holdt indespærret i et CIA torturcenter udenfor Lithauns hovedstad Vilnius hvor han blev underkastet tortur.